Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Cd99l2-202ENSMUST00000080035 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Casc1-201ENSMUST00000060797 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm7328-201ENSMUST00000211123 2225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm12275-201ENSMUST00000119805 307 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Fam229b-204ENSMUST00000134279 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Fam229b-207ENSMUST00000137132 663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm43806-201ENSMUST00000201766 469 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Mbl2-201ENSMUST00000025797 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms