Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms