Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Top2aQ01320 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms