Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms