Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SbdsP70122 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SbdsP70122 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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