Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms