Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprkP35822 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprkP35822 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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