Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RxrgP28705 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms