Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RxraP28700 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RxraP28700 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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