Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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Hoxd10P28359 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms