Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms