Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms