Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtpraP18052 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms