Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
P10404 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
P10404 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms