Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ccl20O89093 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ccl20O89093 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms