Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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