Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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