Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms