Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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