Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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