Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms