Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms