Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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NipblQ6KCD5 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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