Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms