Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms