Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Cntn3Q07409 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Cntn3Q07409 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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