Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NcanP55066 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NcanP55066 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NcanP55066 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NcanP55066 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms