Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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