Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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PtprmP28828 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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