Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Btnl10-201ENSMUST00000020792 1028 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prim1P20664 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms