Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RhoP15409 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RhoP15409 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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