Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm2056J3QQ02 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms