Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smim18J3QNP2 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms