Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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