Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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