Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms