Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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