Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms