Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trappc4Q9ES56 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms