Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Rnft1Q9DCN7 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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