Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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