Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms