Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4Q8VCH8 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms