Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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