Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ccdc18Q640L5 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ccdc18Q640L5 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc18Q640L5 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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