Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms