Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Traf3ip1Q149C2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Traf3ip1Q149C2 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms