Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms