Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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