Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Mmp9P41245 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms